Le site Natura 2000 « Site à chiroptères des Monts du Matin » est centré sur trois tunnels ferroviaires désaffectés qui abritent ensemble la plus importante colonie d'hibernation de Barbastelles d'Europe en Rhône-Alpes. Le périmètre du site englobe également une mosaïque d'habitats favorables à la chasse de nombreuses espèces de chauves-souris. Ces milieux ouverts, forestiers et aquatiques abritent aussi des amphibiens, insectes et crustacés d'intérêt communautaire.
Les principaux enjeux écologiques sur ce site sont :
Le maintien des populations hivernantes de chauves-souris,
Le maintien des pratiques agricoles extensives,
La conservation des milieux aquatiques annexes,
L'évolution de la sylviculture vers des pratiques plus naturelles.
Retrouvez les éléments principaux concernant ce site en consultant le formulaire standard de données (FSD) (accessible sur le site de l'INPN).