Chaque hiver les associations naturalistes se joignent pour réaliser un comptage des populations de chauves-souris occupant les anciens tunnels du site.
Depuis 1998, ce sont au total plusieurs centaines de chiroptères qui sont retrouvés en hibernation dans ces ouvrages.
En 2021, un nouveau record a été atteint pour le tunnel de Viricelles: 781 Barbastelles ont été comptabilisées (précédent record: 669 sur l'hiver 2016/2017). Le tunnel de Malleval comptabilise 133 individus.
De manière générale, près de 70-80% des individus observés sont comptabilisés dans le tunnel de Viricelles. 15-20% sont localisés dans le tunnel du bois de Malleval. Le tunnel de Néronde recense, quant à lui, environ 2% des individus comptabilisés.
En 2021, le passage à grande faune passant sous l'autoroute a également fait l'objet d'un comptage. Aucune trace de Barbastelles mais une cinquantaine de pipistrelles ont été observées.
